Un dels elements distintius del FC Andorra són els colors que vesteixen els seus jugadors. Els colors de la bandera d’Andorra fa més de 75 anys que viuen units en les samarretes dels esportistes del FC Andorra i per això el Club és també conegut com l’equip tricolor. El blau, el groc i el vermell, són els colors que han estat presents, en totes les temporades, en la indumentària de l’equip, singularment a la samarreta oficial de l’equip.